W Instytucie Elektroniki badania naukowe prowadzone są w ramach następujących zespołów:
Zespół Mikroelektroniki
Kierownik: prof. dr hab. inż. Wojciech Kucewicz
Zespół Przetwarzania Sygnałów
Kierownik: dr hab. inż. Konrad Kowalczyk, dr inż. Jakub Gałka
Zespół Rekonfigurowalnych Systemów Obliczeniowych
Kierownik: prof. dr hab. inż. Kazimierz Wiatr
Zespół Układów i Systemów Elektronicznych
Kierownik: dr hab. inż. Witold Machowski, prof. AGH
Zespół Systemów Mikroelektronicznych i Nanoelektronicznych
Kierownik: prof. dr hab. inż. Andrzej Kos
Zespół Optoelektroniki i Techniki Światłowodowej
Kierownik: dr hab. inż. Przemysław Krehlik, prof. AGH
Zespół Techniki Mikrofalowej i Elektroniki Wielkiej Częstotliwości
Kierownik: prof. dr hab. inż. Sławomir Gruszczyński
Zespół Systemów Wbudowanych i Widzenia Komputerowego
Kierownik: prof. dr hab. inż. Bogusław Cyganek
Zespół Mikrosystemów Detekcyjnych i Struktur Optoelektronicznych
Kierownik: prof. dr hab. inż. Tomasz Stapiński
Zespół Magnetycznych Układów Wielowarstwowych i Elektroniki Spinowej
Kierownik: dr hab. inż. Witold Skowroński, prof. AGH
Zespół Cienkich Warstw Półprzewodnikowych na Bazie Tlenków i Azotków Metali
Kierownik: prof. dr hab. Katarzyna Zakrzewska
Zespół Fotowoltaiki i Optoelektroniki Cienkowarstwowej
Kierownik: dr hab. inż. Konstanty Marszałek, prof. AGH
Zespół Przemysłowych Systemów Elektronicznych
Kierownik: dr hab. inż. Cezary Worek, prof. AGH